کمیته‌های تخصصی بانک کارآفرین عبارتند از:

• کمیته بازاریابی و تبلیغات
• کمیته آموزش
• کمیته پیگیری مطالبات معوق و سررسید گذشته
• کمیته مدیریت دارایی و بدهی‌های بانک
• کمیته مدیریت منابع انسانی
• کمیته فن‌آوری اطلاعات
• کمیته تطبیق مقررات و مبارزه با پولشویی
• کمیته برنامه‌ریزی،توسعه و ارتباط با مشتریان
• کمیته ریسک
• کمیته بازرسی